1、原料不同：海鸭蛋指生活在海边红树林中，以海滩中的鱼、虾、蟹、贝类、藻类为食的鸭群所下的蛋。而咸鸭蛋的原材料是普通家里放养的鸭子下的蛋。2、个头不同：海鸭蛋个头会大一些，且里面的蛋黄也比较多。而普通咸鸭蛋个头较小，蛋白比蛋黄更多。
3、做法不同：咸鸭蛋是将普通鸭蛋先煮熟，再裹上食用盐，用保鲜膜包裹好之后进行腌制。而烤海鸭蛋，是将海鸭蛋用火烤熟，再裹上泥巴进行腌制，这样做出来的咸鸭蛋味道更好。
烤海鸭蛋和咸鸭蛋的区别
海鸭蛋指那些生活在海边红树林中鸭群，以海滩中的鱼、虾、蟹、贝类、藻类为主要食物，这类鸭群所产的蛋称为海鸭蛋。主要产区为中国南海北部湾海域国家红树林保护区（湛江、防城港、北海、钦州）、广东电白、台山等沿海地区。
海鸭蛋的食法简单，与鸡、鸭蛋等蛋类相同。蒸、炒、煎、煮均可。特别是煮、煎后的味道和口感更佳，腥味小，蛋黄颜色与普通鸭蛋有较明显的差别。
咸鸭蛋，中国特色菜肴。古称咸杬子。民俗又叫盐鸭蛋”、“腌鸭蛋”、“青蛋”。咸鸭蛋在中国历史悠久，深受老百姓喜爱，在市场上也备受青睐。咸鸭蛋在全国许多地方都有生产，但唯有江苏高邮咸鸭蛋最为著名。袁枚的《随园食单·小菜单》有“腌蛋”一条：“腌蛋以高邮为佳。”
