肽键数=氨基酸数-肽链数。因为两个氨基酸分子脱水缩合形成二肽，中间通过一个肽键相连，三个氨基酸分子脱水缩合形成三肽，中间通过两个肽键相连，若只有一条肽链，肽键数=氨基酸总数-1；若有两条肽链，相当于破坏其中一个肽键，则肽键数=氨基酸总数-2，所以若有多条肽链，肽键数=氨基酸总数-肽链数。
由一氨基酸的羧基与另一氨基酸的氨基脱去一分子水形成的酰氨键称为肽键，写作—CO—NH一。每两个氨基酸相互连接形成一个肽键，多个氨基酸相互连接就形成了多个肽键，由多个氨基酸相互连接形成的含有多个肽键的一条链状结构称为肽链。肽键中的C—N键的键长短于C=N键长，长于一般C—N键的键长；肽键中的C一N键具有部分双键性质，不能自由旋转。
酰胺键和肽键的区别
酰胺键(—CO—N—)中的C和N原子均为sp2杂化，具有平面结构，氮原子上的孤对电子与羰基之间形成p—π共轭体系。由于N原子上电子对的离域化，CN键的键长比胺中C—N键的键长要短，具有部分双键的性质。另外，氧的吸电子作用也使氮上电子云密度降低，从而使氮的碱性减弱。
肽键是由一个氨基酸的羧基与另一个氨基酸的氨基脱水缩合而形成的化学键，也称为酰胺键，写作—CO—NH一。肽键都是酰胺键，酰胺键包括肽键但不等同于肽键。酰胺键所指的范围比肽键的大。
