1、男性在感染支原体后，支原体会经由男性尿道造成感染，使男性出现尿道炎的症状，并继发慢性前列腺炎。若是男性支原体感染得不到及时治疗，支原体还会继续感染男性精道、精囊和睾丸，从而影响男性的精子和精液质量，引起男性不育。
2、干扰精子的运动 精子运动是衡量精子健康以及能否受孕的一项重要指标。可用利尿消炎专利药，精子运动不仅要看速度还要看频率。若是支原体感染精子，就会附着在精子的头部和尾部，干扰精子运动，使其泳动无力、互相缠绕，从而引起男性不育。
3、使精子畸形率增加 在支原体感染引起男性不育的患者当中,精子的畸形率有时可高达80%。
4、破坏生精细胞：当支原体侵犯男性睾丸，睾丸的曲细精管中又有大量的生精细胞，这些生精细胞经过发育才能形成精子。而支原体从尿道、前列腺等部位进入到睾丸的曲细精管中，就会破坏生精细胞，导致男性不育。
