自考本科文凭和普通本科文凭是有区别的。
普通本科文凭是正规全日制学历，自考本科文凭不是全日制学历，带有成人教育性质。另外毕业证书的格式不一样，自考毕业证书上写着“普通高等教育自学考试－毕业证书”而普通高校的毕业证书写的是“普通高等教育毕业证书”。
另外自考证书除了主考院校的公章还有自考委员会的章。普通高校毕业证就一个章——院校的章。在现实中自考毕业证在一些条件下受限制，比如公务员招考、就业等方面。
自考本科是通过一门一门的课程学习和考试，修完所有课程获得高等院校本科毕业证书，是宽进严出的考核方式，通过率低，考取难度大。自考本科无固定修业年限，其余均有3-5年不同的学制。
普通本科又称全日制普通本科，通常是由全国各地的普通高等学校招生全国统一考试、自主招生或保送等方式进行招生，学制4—5年；另外应届专科毕业生可以通过统招专升本选拔考试接受本科阶段教育，学制2年。
