1、一般的水果酵素。如果是要帮助消化的酵素，可以和食物一起配服；如果是要清肠、改善便秘的酵素，通常是空腹服用。有胃痛困扰者则不宜空腹吃，建议在餐和餐之间补充。
2、比较少见的模袈咐漩酵素。以冲绳酵素为例。冲绳酵素与其他酵素有着巨大的差别——冲绳酵素以珍贵药材为主要原材料，辅之以水果蔬菜，精选冲绳三大药草“猫须草、郁金、番桃叶”和有长命草之称的礴斑又虫牡丹皮防风等50种严选素材的植物发酵精华。而其他酵素一般均以普通水果为原料。所以冲绳酵素相比其他酵素更加温和，更带有独特的滋养身体的功能。这种酵素相比之下，可以搭配食用的选择就更多。搭配红酒。红酒可以加雪碧，但是下次可以不妨尝试加冲绳酵素。红酒具有很强的抗氧化的作用，而冲绳酵素可以减肥瘦身、滋养身体。两者搭配一起喝可以养颜又瘦身。搭配汉方大麦若叶。大麦若叶青汁可以加速排除肠胃内的酒精及脂肪，缓解宿醉和油腻感，对便秘有特别好的效果，适合生活无规律、经常在外应酬者。而冲绳酵素的一个很突出的作用就是，促进新陈代谢，与汉方大麦若叶一起，减肥效果更加突出。
