1、免疫原因。扁平苔藓的出现与患者自身的免疫有关，患者病情的复发、波动，患者体内的淋巴细胞也在变化。
2、微量元素。微量元素虽然含量少，但是对人体的作用很大，微量元素的缺乏会导致人体内一部分生理功能发生改变导致扁平苔藓的发生。
3、遗传因素。患扁平苔藓家族史者携带一种致病基因，并且家族中携带基因的发病率远远高于普通人群，这些说明，扁平苔藓发病可能与遗传因素有关。
4、金属物体的刺激。银汞填充体可诱发扁平苔藓、铜、锌、银等金属可能令患者产生变态反应，一些戴假牙的人群更容易诱发皮炎湿疹。
5、内分泌原因。女性扁平苔藓患者常在月经期间或妊娠、更年期发病或导致病情加重，这个时期人体的内分泌变化很大，推测内分泌原因也是引起扁平苔藓发作的原因。
