1、一、子结构的连接点
1、选择【连接点】工具；
2、在子结构要放置连接点的位置上（下图左一蓝色阴影处）单击，单击后该位置会出现一个连接点编号；
3、对所有子结构重复以上操作。
2、二、连接点的编号
如果在Preferences对话框中选择了Building/Display下的Show Attachment Rank Indicators（显示等级指示号），将会在文档窗口看见连接点编号。这些编号对应ChemBioDraw取代基父结构上的键等级数，指示子结构是如何连接在父结构上。对于子结构而言，连接点编号与键形成一个组合键。
当建立一个已经含有定义的ChemBioDraw取代基的父结构（化合物），再单击【连接点】工具时，取代基标记的附近会自动出现一个等级数（下图右一红框内）。键等级数与定义中连接点的编号是一致的。下图左一为父结构，中间为取代基框，右一为等级数出现。
3、三、F1查询文件
在ChemBioDraw 查询结构中，完成了的查询可被保存为F1查询文件。F1查询文件中未在ChemBioDraw取代基框中的将被解释为G0。以G-基团为例，如果取代基标记不是G1、G2、G3等，在写到F1查询格式时将被重命名。
