旱地果园只适合套种耐旱的中药材，如柴胡、黄芩、黄芪、知母等。水地果园可套种较喜湿润、不耐寒的元胡、附子、北沙参等。山区果园应套种喜湿怕热的黄连、党参、麦冬、西洋参等。
根据树种套种
枣树、柿子树等发芽较迟的果树，可套种喜光但有夏眠习性的贝母、元胡等。桃、杏、樱桃等果熟期在最热月份到来之前的果树，可套种喜热怕践踏的茯苓等中药材，还可利用此阶段树冠的保湿、遮阳作用挂袋生产木耳和银耳。
根据树龄套种
幼龄果园因尚未封行可在行间栽种1—3年收获的地黄、远志、黄芩、菊花、黄芪、牛膝、板蓝根、白术、柴胡等喜光中药材。成龄果园则应套种喜阴或耐阴的中药材。
根据树冠情况套种
树冠及树叶较稠密的果树，如桃、樱桃、杏、葡萄、柿子树等，可套种半夏、天麻、灵芝、黄连等喜阴湿的中药材。树冠较稀疏的果树，如苹果、梨、山楂等则可套种丹参、百合、天门冬等稍耐阴湿的中药材。
