区别一：提炼原料不同。
鲜胚玉米油是在玉米精炼油的基础上经过脱磷、脱酸、脱胶、脱色、脱臭和脱蜡精制而成的，而玉米胚芽油选取用上乘玉米胚芽，采用国际先进技术精制而成。
区别二:营养成分些许不同。
鲜胚玉米油富含多种维生素（维生素A、维生素D、维生素E、维生素K等）、矿物质（钙、镁、钾、钠、磷等）及大量的不饱和脂肪酸，而玉米胚芽油富含人体必须的维生素E和不饱和脂肪酸，含量达80%以上，主要为亚油酸和油酸。
区别三：加工工艺些许不同。
鲜胚玉米油经过将玉米润水、脱皮破糁、分选提胚、压胚筛选、提纯、干燥、压榨而成，玉米胚芽油是经过清理、干燥、软化、轧胚、蒸炒、压榨、高温蒸炒、精炼处理而成。
