1、当仓鼠在幼儿期的时候，可以通过观察乳头来判断公母，公的不含有乳头；母的含有乳头；（这个时期是很难判断性别的）
2、当仓鼠性成熟以后（一般两个半月就会达到性成熟），就可以通过观察生殖器官来判断了。母的生殖器官和肛门离得很近，中间没有毛；公的生殖器官和肛门离得较远，两者之间有毛。
3、当成熟以后，可以看到公的有明显的睾丸，公的有香腺，当他正常的时候成块状，发情以后会变的潮湿，并有一股臭的味道。
4、还有就是不明的判断方法了，公鼠的屁股较大，母鼠的屁股较小；还有就是看眼睛，公鼠的眼睛边缘比较尖眼角偏下，看起来是比较扁的，母鼠的眼睛比较圆（这个方法适用于成年鼠）。
