临床发现轻型进行性延髓麻痹病人行脑干听觉诱发电位检查，有一半病例有器质性损害。这表明进行性延髓麻痹的发病因素并不是单一存在的。
什么原因导致进行性延髓麻痹的发生?
进行性延髓麻痹动物实验中发现延髓有线粒体、尼氏体、染色体改变，有的伴溶酶体膜破裂，可引起脑干的直接与间接受损。
进行性延髓麻痹病人的脑脊液化验中，乙酰胆碱、钾离子浓度升高，此两种物质浓度升高使神经元突触发生传导阻滞，从而使脑干网状结构不能维持人的觉醒状态，出现意识障碍。
进行性延髓麻痹、原发性脑干损伤、弥漫性轴索损伤的致伤机制相似，只是损伤程度不同，是病理程度不同的连续体，有人将进行性延髓麻痹归于弥漫性轴索损伤的最轻类型，只不过病变局限、损害更趋于功能性而易于自行修复，因此意识障碍呈一过性。
暴力作用于头部，可以造成冲击点、对冲部位、延髓及高颈髓的组织学改变。
