1、志愿投档规则不同。
自荐生志愿的投档规则是平等志愿，可以填报2所学校，没有所谓第一志愿和第二志愿之分，填完以后同时投档。所以理论上是有可能收到两所学校的自荐生考试通知的。
推荐生志愿的投档规则是顺序志愿，同样填写2所学校，但是在投档时各学校会优先检索第一志愿填报该学校的学生。如果第一志愿招满，则不会考虑第二志愿报考该学校的学生。对于推荐生实际的操作结果是，可以直接去第一志愿填报的学校参加校测，第二所学校录取概率渺茫。
2、录取流程不同。
自荐生：可参加两所学校的自荐考试，然后根据录取结果选择一所高中进行签约。
推荐生：参加完考试后，登陆上海招考热线查看结果，如果是预录取状态则无需再进行网上签约，只需等待公示。如果没有被录取，则有一次征求志愿的机会。
3、填报的高中和竞争范围不同。
自荐生：全市任意2所有自荐生招生计划的市重点高中，不限区域。这就意味着考生要与全市所有填报这所高中的自荐生一起竞争。
推荐生：在该区有推荐生计划的高中，具体需要看当年教委公布的计划。不过可以确定的是，市重点高中对本区推优生计划数有明显倾斜。推荐生要和本区填报同一所高中的同学一起竞争。
