1、 导致习惯性流产原因有很多，包括免疫性因素、感染性因素、遗传性因素、内分泌性因素、解剖因素等，而其中免疫性因素导致的流产占习惯性流产的67%之多，解剖因素占14%、内分泌因素11%、遗传因素占5%、其它因素占3%。
2、 在妊娠早期发生习惯性流产者中，60%以上是由于孕妇体内存在免疫遗传基因缺陷，或受外界不良环境如辐射、药物等影响而导致胚胎染色体异常所造成。此外，习惯性早期流产的原因还有黄体功能不全、甲状腺功能减退、子宫畸形、子宫腔粘连、子宫肌瘤等。
3、 习惯性晚期流产最常见的原因是子宫颈内口松弛，可因先天性发育异常，也可因分娩、刮宫或子宫颈手术造成。另外，梅毒感染也可导致习惯性晚期流产，这种流产的胎儿几乎都是死胎。
