1、化学消毒。主要是用一些消毒剂对汽车进行喷洒和擦拭来除去病菌。但这些消毒液会对汽车的金属部件有一定的腐蚀性，而且对空中飘浮的飞沫、细菌并没有多大作用。
2、臭氧消毒。这是目前被广泛采用的方式，优点是消毒时间短，对车内的细菌消除彻底，也不会造成二次污染。美中不足的是无法消灭空调蒸发器内的细菌，而且臭氧管易衰减老化,消毒后车内会残留异味，效果持续时间短，需要定期消毒。
3、蒸汽消毒。我们平时说的汽车桑拿,用蒸汽来杀菌消毒,或利用汽车空调的制热功能冲洗空调蒸发器，同时用空调热风烘干达到除味、杀菌的目的。但霉菌有着顽强的耐高温生存能力，例如黄曲霉素，既使在300℃的高温环境下仍不能被完全破坏，因此，单纯依靠空调热风烘干除霉的效果一般。
