1、1、矩阵式组织与项目化运作
在智力型企业，研发项目、解决方案营销、大量的客户定制方案设计与实施等都是通过项目组织形式实现的，因此矩阵组织模式运用会非常普遍。这样就带来一个问题，不断有跨部门的项目组成立、撤销，同时还存在某一员工同时跨多个项目组的情形。
2、2、直线经理和员工具有更强的自主性和参与意识
在很多智力型企业，无论直线经理，还是一般员工，都对人力资源管理具有很强的参与要求；人力资源部也非常关注员工对人力资源管理的满意度，人力资源部门不再是一个权力中心或者是后勤部门，而应当首先成为服务中心、资源中心。
智力型企业的基本特征即在于利用新知识、新技术创造高附加值的产品或服务，这也决定了智力型企业在企业管理上与传统的企业具有很大的差异。
3、3、人员高流动性带来的大量招聘需求
智力型企业员工，特别是核心员工是绝对的稀缺人才，因此竞争十分激烈；同时，由于知识员工具有较强的自我实现意识，更加忠于职业而不是企业，很多智力型企业员工流动率居高不下。据一项调查显示，北京市创新型企业人才流动率超过20%。岗位空缺持续时间越长，对企业正常经营的影响越大、成本越高。
矩阵组织和持续的组织调整必然要求人力资源管理与之同步，这就一方面造成人资部门工作量大幅增加，另一方面提高了工作复杂性，且对精细化要求更高；而不断的组织调整又往往使人力资源管理各项职能也处于经常变动之中。
